Venti predominanti : sono il Ponente e lo Scirocco per il primo la penisola di Milazzo offre un buon riparo, per il secondo la baia e completamente scoperta. Talvolta con vento di ponente di notevole intensità (caratterizzato da raffiche), risultano molto difficoltose le manovre di ormeggio e disormeggio ai pontili. Dal I quadrante provengono venti di traversia, essi si verificano poche volte e nei mesi invernali, le onde da essi generate raggiungono notevole altezza rendendo inoperosi i pontili. Con i venti dal III e Iv quadrante sia il porto che la reda sono ben riparati e quindi permettono lo svolgimento ragolare delle operazioni commerciali offrendo in più rifugio alle navi da rilascio. I venti dal II quadrante quando sono molto forti rendono difficoltose le operazioni di ormeggio sia ai pontili che in porto.

Correnti e Maree : Le correnti , sia in porto che in rada, sono di scarso rilievo e risentono dell'azione del vento. La marca,alquanto irregolare, ha pure scarsa importanza in quanto varia fino a circa 30 cm dal livello m.m